El formato MP3 tiene incorporado un sistema llamado ID3 donde se guarda cierta información (metadatos): nombre del artista, de la canción, del álbum donde está incluída, del año de publicación, del género y entre otras cosas (y a lo que vamos) imágenes como la carátula del álbum (desde la versión ID3v2).
Aplicaciones para organizar MP3 y descargar carátulas
Zortam ID3 Tag Editor: Un organizador con multitud de opciones de renombrado, búsqueda de duplicados, actualización masiva (por lotes) de carátulas de MP3, etc. Especialmente cómodo porque puedes ver (en fondo verde) las canciones que contienen imagenes o ilustraciones.
Amazon Cover Downloader: Esta aplicación se encarga de descargar la carátula de los tags de los artistas que le indiques manualmente. Bastante útil si no lo encuentras con sistemas automáticos y quieres hacerlo de una forma rápida y fácil.
The Cover & TAG: Este sistema es un plug-in para el famoso reproductor de MP3, Winamp. Excelente para los que quieren visualizar las imagenes mientras siguen utilizando el reproductor por excelencia.
iTunes Companion: Para los que aman el iTunes, este plug-in está disponible para el Konfabulator, un sistema de widgets originario de Mac OS y propiedad de Yahoo!, que además ha sido exportado también para los sistemas Windows.
MP3 Tag Editor: Aunque no permite la actualización de carátulas directamente por internet, es altamente recomendado por su facilidad de uso, sencillez de interfaz y ser una alternativa totalmente gratis.
ImageTagger: Sencillo y rápido. Permite seleccionar entre carpetas y ficheros independientes de una forma simple. Es una alternativa open source.
Album Art Aggregator: Aunque el sistema de etiquetado no es muy potente, tiene la ventaja de que muestra hasta tres carátulas encontradas para poder seleccionar entre ellas y asignarlas a los MP3.
Si ninguno de ellos te convencen, también puedes probar otros como Album Art (aplicación web), TagRunner, The GodFather o Album Cover Art Downloader, este último para Windows y Linux.